與其他能源載體一樣，氫在大規模使用時也會帶來某些健康和安全風險。氫氣作為一種小分子的輕氣體，需要特殊的設備和程序來處理。氫分子非常小，它可以擴散到某些材料中，包括某些類型的鐵管和鋼管，並增加其失效的可能性。它比較大的分子（如天然氣）更容易透過密封圈和連接器逃逸。因此，液氫作為船用燃料存在獨特的危害。
氫的物理特徵
氫氣由於密度極低，通常採用壓縮或低溫液化的方式提升儲存的體積能量密度，在常壓下冷卻到20.28K（-252.87°C）時被完全液化。為了維持液化狀態，液氫必須加壓並保持低溫，因此液氫的儲槽必須是承壓和絕熱的密閉容器。而氫氣與液氫的體積比是825，在完全灌滿液氫的密閉儲槽如果溫度升至300K常溫，儲槽的最終壓力將上升至172MPa，這是一般壓力容器無法承受的。而液氫的沸點非常低（20.369K），一旦液氫溫度超過沸點（例如儲槽的絕熱系統有微小的熱洩漏），液氫化導致的體積膨脹將導致儲槽超壓破裂。
液氫相關的危害
- 與壓力相關的危害
- 晃動sloshing：液位不同，船舶運動(滾動、俯仰等)導致的液氫在儲槽內晃動可能會產生晃動波。這些晃動波會衝擊儲槽，有可能造成儲槽損壞；
- 液氫膨脹：通常船用氫燃料以液態形式儲存。在儲存過程中，液態氫將尋求與周圍環境達到平衡並蒸發，可能產生顯著的超壓；
- 正氫到仲氫的過渡：氫在液化和貯存時，由於自動催化作用，正氫會轉化為仲氫並放出熱量，使液態氫產生蒸發損失。如果初始液氫中正氫含量高，它將自然地轉變為較低能量的仲氫，同時釋放足夠的熱量以引起液氫的額外沸騰，從而增加總的蒸發速率；
- 分層與翻轉：由於燃料儲槽內的溫度梯度或正氫到仲氫的轉化，可能會發生密度變化，導致分層。分層翻轉會導致液氫蒸汽的快速釋放,進而產生超壓。
2. 與材料相關的危害
- 脆性斷裂：液氫燃料加注裝置、液氫燃料安全殼系統和燃料供應系統低溫側的極低溫度，可能引起管線和部件的脆性斷裂；
- 氫脆：氫原子非常小，可以在固體金屬中滲透擴散，暴露於氫氣中的金屬材料可能會因其微觀結構的變化而失去延展性，從而導致開裂和災難性失效；
- 高溫氫蝕：高溫氫蝕ITHA )發生在高溫下長時間暴露於氫氣的鋼材中，最有可能發生在較高應力的區域，如焊縫。
3. 氫氣洩漏火災危害
氫氣在空氣中的可燃範圍更廣，並且與天然氣相比，點燃釋放的氫氣所需的點火能量要低許多，氫氣火災的可能性會大得多；
噴射火焰(Jet Fire)：在安全殼系統、製程設備或管道工程含有加壓氫氣或液態氫氣或氫氣蒸汽的地方，由於連續加壓氫氣意外洩漏並點燃，可能會發生噴射火焰；
池火(Pool Fire)：當液態氫釋放到表面或水中並隨後被點燃時，會導致池火；
閃火(Flash Fire)：由於洩漏的可能性高，氫氣在空氣中的易燃範圍更廣以及點燃釋放物所需的點火能量更低，氫氣閃火的可能性可能會大得多。
4. 氫氣洩漏爆炸的危害
- 沸騰液體膨脹蒸汽爆炸(BLEVE)：液氫儲罐都有安裝過壓保護系統，通常在絕熱系統失效時可以透過洩壓裝置安全的將壓力釋放，但是在過壓保護系統失效，或者在外部發生火災，儲槽被外部加熱時，內部壓力來不及釋放的情況下仍可能發生BLEVE危害，儲罐超壓爆炸，大量氫氣洩漏導致事故進一步惡化；
- 快速相變(RPT)：液態氫大量釋放到水中後，液態氫迅速蒸發為氫氣。RPT現象會導致物理性的爆炸(非燃燒)，並產生過壓衝擊波；
- 爆燃、爆震：火焰傳播速速不同，氫氣點燃後可能引起爆燃或爆震。於天然氣相比，氫氣的傳播速度更快，超壓更高，因此氫氣的爆炸後果更嚴重。
5. 氫氣洩漏引起的人員接觸危害
- 與液化天然氣相比，液態氫的溫度低，因此人員接觸後的低溫燒傷和凍傷後果更為嚴重；
- 窒息風險：液態氫初期蒸發氣溫很低，在一段時間內比空氣重。因此，氫氣不會立即向上擴散，而是會在較低位置積聚，置換空氣。少量液態氫將產生大量氫氣，可能在封閉或受限空間中大量置換空氣，造成氧氣不足。此外，由於液氫的極低溫度，空氣發生冷疑的過程中，氧氣先於氮氣冷疑。同理在隨後的蒸發過程中，氮氣會先於氧氣蒸發。這兩種情況都可能引起密閉空間氧氣濃度降低。
總之，氫有自己鮮明的特性，在某種程度上，比其它燃料和氣體更危險。只要充分了解氫的特性，針對性的採取各種安全措施（包括技術措施，和組織管理措施。），氫的安全性是有保證的。在工程實務中，各種安全措施必須充分考慮氫氣/液氫的理化特性，氫氣/液氫的各種危險以及可能的危險事件/危險場景。